美高梅簡介

    美高梅4686高等研究院是美高梅4686新成立的一個包含本科與研究生培養、側重跨學科教學與研究的校內綜合辦學單位。作為美高梅4686內部探索全面改革創新的學術特區,高等研究院與香港和海外著名高校合作,借鑒國外研究型大學通行的管理模式,引進具有一流視野的資深教授和發展潛力的青年教師,營造與國際接軌的學術氛圍和培養環境,開展卓越的教學、研究和管理工作。 ······

研究生課程

李文金

博士,研究員

郵箱:liwenjin(at)szu(dot)edu(dot)cn

地址:美高梅4686辦公樓341室


教育背景:

2012 中科院上海生命科學研究院計算生物學研究所,計算生物學,博士

2009.11-2010.10 德國海德堡理論研究所,中歐聯合培養博士生

2010.11-2011.12 德國馬普生物物理化學研究所,中歐聯合培養博士生

2004 浙江大學材料與化學工程美高梅,生物工程,學士


工作經歷:

2017.3-2017.6 中科院大連化學物理研究所,助理研究員

2013.3-2016.12 美國伊利諾伊大學芝加哥分校,博士后

2012.10-2013.2 德國海德堡理論研究所, 博士后


研究興趣:

主要運用分子動力學模擬,并結合統計物理和量子化學理論知識,從原子水平理解蛋白質的結構和功能,特別是酶的催化反應機理。同時開發相關的計算方法,包括增強采樣方法、自由能計算以及相互作用能分析。此研究或可應用于蛋白質工程和藥物開發。


代表性文章列表:

Li W, and Ma A. A Benchmark for Reaction Coordinates in the Transition Path Ensemble. J. Chem. Phys. 144(13), 134104 (2016).

Li W, and Ma A. Some Studies on Generalized Coordinate Sets for Polyatomic Molecules. J. Chem. Phys. 143 (22), 224103 (2015).

Li W, Edwards SA, Lu L, Kubar T, Patil SP, Grubmueller H, Groenhof G, and Graeter F. Force Distribution Analysis of Mechanochemically Reactive Dimethylcyclobutene. ChemPhysChem 14 (12), 2687-2697 (2013)

Li W, Rudack T, Gerwert K, Graeter F, and Schlitter J. Exploring the Multi-Dimensional Free Energy Surface of Phosphoester Hydrolysis with Constrained QM/MM Dynamics. J. Chem. Theor. Comput. 8 (10), 3596-3604 (2012)

Li W, and Graeter F. Atomistic Evidence of How Force Dynamically Regulates Thiol/Disulfide Exchange. J. Am. Chem. Soc. 132 (47), 16790-16795 (2010)

Li W, Lin K, Feng K, and Cai Y. Prediction of Protein Structural Classes Using Hybrid Properties. Molec. Divers. 12, 171-179 (2008)


專著章節:

Graeter F, and Li W. Transition Path Sampling with Quantum/Classical Mechanics for Reaction Rates. In: Kukol A (ed) Molecular Modelling of Proteins, 2nd edition. Springer, New York. 2015.

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